Con Duendes se inicia la publicación en forma novelada de los famosos Expedientes X popularizados por la serie de televisión. En este primer caso, los dos agentes del FBI -el inconformista Mulder y la cerebral Scully- investigan dos misteriosos asesinatos ocurridos en las inmediaciones de una base militar en proceso de desmantelamiento. Ambas víctimas presentan heridas idénticas: un único corte limpio en la garganta, como si no hubiesen visto acercarse a su verdugo. Todo parece indicar que en la base se llevan a cabo extraños experimentos.